商店营业厅设置在地下二层

3.4米自然要算层数的

按建规 营业厅、展览厅不应设置在地下三层及以下楼层

50016-2014（2018）

5.4.3 商店建筑、展览建筑采用三级耐火等级建筑时，不应超过2层；采用四级耐火等级建筑时，应为单层。营业厅、展览厅设置在三级耐火等级的建筑内时，应布置在首层或二层；设置在四级耐火等级的建筑内时，应布置在首层。    营业厅、展览厅不应设置在地下三层及以下楼层。地下或半地下营业厅、展览厅不应经营、储存和展示甲、乙类火灾危险性物品。

人民防空工程设计防火规范 GB50098-2009 

3.1.6 地下商店应符合下列规定：     1 不应经营和储存火灾危险性为甲、乙类储存物品属性的商品；     2 营业厅不应设置在地下三层及三层以下；

未见剖面图不好确定，从你文字表述来看，你表述的地下二层应该实际是地下三层，应该是禁止设置商店的。